What is hiding behind S100 protein and SOX10 positive oncocytomas? Oncocytic pleomorphic adenoma and myoepithelioma with novel gene fusions in a subset of cases

Oncocytomas (OCs) in salivary glands are rare benign tumors composed of mitochondriarich epithelial cells (oncocytes), mostly localized in the parotid gland. The treatment of choice is simple excision. Extensive oncocytic metaplasia of pleomorphic adenoma (PA) and myoepithelioma (ME) can be diagnostically challenging and may camouflage the correct diagnosis. These tumors should be treated more carefully compared with OC, given the risk of frequent recurrences and the possibility of malignant transformation.We have investigated 89 oncocytic lesions from our files, including OC (n = 74) and metaplastic oncocytic variant of PA/ME (n = 15). All OCs were stained for 5100 protein and SOX10. The tumors with immunohistochemical expression of one or both markers were tested by next-generation sequencing (NGS). The NGS results were confirmed by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and/or fluorescence in situ hybridization (FISH).Ten cases originally diagnosed as OC, and 1 low-grade uncertain oncocytic tumor (11/74) revealed nuclear-cytoplasmic and/or nuclear positivity for S100 protein and/or SOX10, respectively. Fusion transcripts CHCHD7-PLAG1 and GEM-PLAG1 were found in 2 cases (1 fusion in each), and these were confirmed by RT-PCR and PLAG1 break-apart FISH probe, respectively. Another 5 cases were positive for PLAG1 rearrangement by FISH. In the control group of 15 oncocytic PA/ME, 4/15 tested tumors harbored gene fusions including NFT3-PLAG1, CHCHD7-PLAG1, FBX032-PLAG1, and Clorf116-PLAG1 (1 fusion in each case) as detected by NGS. Two fusions were confirmed by RTPCR, 1 case by FISH, and 1 case was not analyzable by FISH.We additionally tested 24 OCs negative for 5100 protein and SOX10 by immunohistochemistry (IHC) and by FISH for rearrangement of PLAG1 gene, but none of them were positive.SOX10 and/or 5100 protein immunopositivity in conjunction with rearrangement of the PLAG1 gene assisted in reclassification of a subset of oncocytomas as oncocytic variants of PA and ME. Therefore, we recommend to include S100 protein and SOX10 IHC when diagnosing tumors with predominantly oncocytoma-like differentiation. In addition, by NGS, 3 new gene fusions were detected in oncocytic ME, including NTF3-PLAG1, FBX032-PLAG1, and GEM-PLAG1, and a new fusion Clorf116-PLAG1 was detected in oncocytic PA. (C) 2020 Elsevier Inc. All rights reserved

Imunohistochemické a vybrané genetické reflexní testy pro všechny děložní leiomyosarkomy a STUMP pro genové přeskupení ALK mohou poskytovat účinný screeningový nástroj pro identifikaci mezenchymálních nádorů s přeskupeným ALK

Zkoumali jsme hodnotu cíleného molekulárního screeningu pro identifikaci mezenchymálních nádorů s přesmykem děložního anaplastického lymfomu (ALK), včetně imunohistochemie ALK následované molekulárně genetickým testováním, u všech děložních leiomyosarkomů a STUMP (nádory hladkého svalstva s nejistým maligním potenciálem). Všechny případy leiomyosarkomu a STUMP diagnostikované v 10letém období (2006–2016) na LF UK v Plzni byly získány a přezkoumány. Z 23 případů byl jeden případ (LMS [leiomyosarkom]) pozitivní na přeskupení ALK, a to fúzní gen PPP1CB – ALK. V tomto případě nebyly pozorovány žádné specifické histologické znaky (tj. Lymfocytární infiltrát a stromální edém). To naznačuje, že histologické rysy podobné zánětlivým myofibroblastickým nádorům (IMT) nemusí být počátečním spolehlivým screeningovým nástrojem při identifikaci děložních IMT případů. Navrhli jsme tedy dvoustupňové IHC a molekulární genetické testování (jako reflexní test) na IMT ve všech případech LMS a STUMP dělohy. To zlepší správnou detekci nádorů tohoto typu v populaci a tím se vytvoří možnost pro dostupnou a cílenou terapii.In a recent paper in Electron. J. Combin. 23 (2016) Estélyi and Pisanski raised a question whether there exist vertex-transitive Haar graphs that are not Cayley graphs. In this note we construct an infinite family of trivalent Haar graphs that are vertex-transitive but non-Cayley. The smallest example has 40 vertices and is the well-known Kronecker cover over the dodecahedron graph G(10,2), occurring as the graph ‘40’ in the Foster census of connected symmetric trivalent graphs